Аудиторской проверке подлежат все предприятия, которые соответствуют требованиям и критериям, изложенным в Правилах «Особенности аудита малых экономических субъектов», причем предприятиям, в которых доля государственной собственности (или собственности субъектов РФ) – менее 25%, предоставлено право выбора аудитора. В остальных случаях предприятие обязано выбирать аудитора из организаций, которые победили в открытом конкурсе на право проведения открытых аудиторских проверок таких предприятий.
В период предварительной проверки к проведению аудита следует изучить систему учета и самоконтроля предприятия малого бизнеса, согласовать в письменном виде (в договоре или стандартном письме-обязательстве) все условия предоставления аудиторских услуг. При проведении проверки предприятий малого предпринимательства, особенно тех, которые работают на упрощенной системе налогообложения, рекомендуется за основу брать оценку надежности внутреннего контроля как «низкая», а также увеличить объем аудиторских выборок с целью минимизации риска необнаружения.
При проверках малых предприятий существуют также некоторые особенности при получении аудиторских доказательств. В частности, следует особое внимание уделить получению письменных объяснений руководства предприятия по поводу спорных моментов, выявленных в процессе проверки, которые в этом случае считаются одним из видов аудиторских доказательств, требующих проверки. Необходимо также учесть специфику нормативной и законодательной базы субъектов малого предпринимательства. Особое внимание стоит обратить на обоснованность применения аудируемым предприятием упрощенной системы налогообложения и отражение всех проводимых операций в книге учета доходов и расходов. К проверке малых предприятий проверяющий должен подходить с профессиональным скептицизмом, который поможет получить достоверные аудиторские доказательства для составления аудиторского заключения.